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小麦（Triticum aestivum）15K育种芯片包含 13,947 SNP标记，其中 1,272 为功能标记，12,674 为基因组覆盖标记。

芯片设计要点如下：

1. 标记质量高、稳定性高；

2. 标记均匀覆盖基因组；

3. 标记多态性高；

4. 包含抗赤霉病、抗条锈病、株高、产量、芒长、光周期等功能标记；

对小麦材料进行小麦15K育种芯片检测，然后进行以下分析：

1、通过功能标记对每份材料的赤霉病抗性等性状进行预测；

2、通过功能标记将优良农艺性状导入现有材料，同时通过背景标记确保原有农艺性状不变；

3、将所有材料进行划群分析；

4、计算所有材料间的遗传相似度；

5、计算每份材料与小麦骨干材料的遗传相似度；

6、结合表型数据进行基因定位；

7、结合表型数据进行表型预测；

8、进行遗传图谱、遗传多样性、连锁强度等遗传学分析；

9、得到高密度品种指纹图谱，可以结合对照样本进行品种真实性分析；

1、江苏里下河地区农业科学研究所

2、江苏省农科院

3、南京农业大学

4、西北农林科技大学

5、中国农业科学院作物研究所

6、中国科学院遗传与发育生物学研究所农业资源研究中心

7、中国科学院植物研究所

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