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玉米48K液相基因芯片


dhy大红鹰官方网站一直致力于建立平台型生物育种创新技术体系,为解决我国种业“卡脖子”技术提供支撑。为适应新时期玉米育种发展要求的,增强我国玉米新品种培育的自主创新能力,促进我国玉米种业发展,公司在玉米DH种质创制,玉米品种改良,分子辅助育种,全基因组选择育种等方面提供一体化,平台型分子育种服务解决方案。玉米基因组产品线持续升级更新,继玉米580多重PCR Panel,玉米10K育种芯片,玉米56K基因芯片等产品之后,再添“芯”成员--玉米48K液相基因芯片。

基因芯片设计参数

芯片位点来源:

CGMB Maize 56K基因芯片,数百份玉米全基因组重测序数据
标记探针统计:

1. 总标记探针数:47827 

2. Gene区探针数:29028 

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产品特点及优势

1、有效标记多,质量高,稳定性好:

挑选位点来源于超2万份以上国内外玉米种质材料验证,及新的代表性重测序数据;

2、适用多种玉米种质材料:

标记位点包含代表温带种质材料和热带种质材料的多态性位点;

3、基因组信息完善及全新位点检出更灵活:

默认参考基因组版本为玉米B73 RefGen_v4,根据检测材料灵活选择不同玉米参考基因组及版本。可发现并检出新位点信息;

4、标记分布均匀及加入玉米品种确权核心位点:

均匀覆盖了玉米全基因组。同时加入品种确权核心位点;

5、性价比更加突出:

以二代测序技术为基础,探针区域捕获2*150bp测序,检出位点比48K探针数量更多。

产品应用

一、科研应用

1. 遗传图谱构建;
2. QTL定位、 BSA分析;

3. 群体遗传学、群体进化;

4. 全基因组关联分析(GWAS);

二、育种应用

1. 分子标记辅助育种(MAS)、全基因组选择育种(GS);

2. 品种DNA指纹鉴定、品种产权保护;

3. 种子纯度和真实性鉴定;

4. 杂种优势群划分,群体结构及亲缘关系分析;

应用案例

1、育种公司基于玉米48K液相基因芯片,开展核心育种材料的种质资源分析,同时参考dhy大红鹰官方网站基因数据库中的几十份代表性玉米CK材料,进行分析后续指导育种。


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2、大学科研客户基于玉米48K液相基因芯片,开展群体GWAS分析。
300多份自然群体材料,检测玉米48K液相基因芯片,用GATK进行变异检测,同时过滤得到超过280K的高质量标记。使用vcftools及进行群体标记过滤,得到超过150K的高质量多态性标记用于后续科研数据分析。

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业务咨询

电话:13910342709 15313080697
邮箱:lianxi@cgmb.com.cn

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