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玉米（Zea mays）10K育种芯片包含 9,433 SNP标记，其中 1,206 为功能标记，8,227 为基因组覆盖标记。

芯片设计要点如下：

1、标记质量高、稳定性高

2、标记均匀覆盖基因组

3、标记多态性高

4、包含抗丝黑穗病、抗茎腐病、抗南方锈病、穗轴色、抗旱等功能标记

5、覆盖热带种质多态性

对玉米自交系材料进行玉米10K育种芯片检测，然后进行以下分析：

1、判断材料的杂种优势群归属

2、拆分材料中不同血缘所占比例

3、计算所有材料间的遗传相似度

4、计算每份材料与玉米骨干自交系的遗传相似度

5、通过功能标记对每份材料的丝黑穗病抗性、茎腐病抗性等性状进行预测

6、通过功能标记将优良农艺性状导入现有自交系，同时通过背景标记确保原有农艺性状不变

7、结合表型数据进行基因定位

8、结合表型数据进行表型预测

9、进行遗传图谱、遗传多样性、连锁强度等遗传学分析

10、得到高密度品种指纹图谱，可以结合对照样本进行品种真实性分析

1、广东省农业科学院

2、华中农业大学

3、中国农业科学院作物科学研究所

4、中国农业大学

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